年   度 獲獎人 系所別
1999 陳力俊 材料
2000 陳文村 資工
2001~2004 無人獲獎
2005 張正尚 通訊
2006 無人獲獎
2007 陳壽安 化工
2008 黃惠良 電機
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*註:自89年度起改為「總統科學獎」

年   度 獲獎人 系所別
88年度 蕭啟慶 歷史
于   靖 數學(兼任)
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年   度 獲獎人 系所別
85年度 洪一峰 工工
施漢章 材料
馬振基 化工
徐清祥 電機
86年度 張榮語 化工
宋震國 動機
黃能富 資工
88年度 林諭男 材料中心
王奕凱 化工
洪一峰 工工
89年度 吳誠文 電機
葉均蔚 材料
李政崑 資工
簡禎富 工工
90年度 許棟樑 工工
91年度 蔡春鴻 工科
柳克強 工科
林滄浪 工科
林    強 工科
潘    欽 工科
胡    瑗 工科
張廖貴術 工科
暫停舉辦
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年   度 獲獎人 系所別
82年度 黃一農 歷史
83年度 王秋桂 人類
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年   度 獲獎人 系所別
1994 黃惠良 電子
1998 李三保 材料
陳壽安 化工
金重勳 材料
陳力俊 材料
薛敬和 化工
吳茂昆 物理
2000 陳壽安 人類
2003 張石麟 物理
2008 吳泰伯 材料
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年   度 獲獎人 系所別
82年度 李遠鵬 化學
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年   度 獲獎人 系所別
84年度 李家同 資訊
87年度 潘晴財 電機
90年度 陳力俊 材料
93年度 陳壽安 化工
94年度 張石麟 物理
96年度 黃惠良 電機
97年度 馬振基 化工
江安世 生科
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年   度 獲獎人 系所別
91年度 林長壽 理論中心
92年度 朱國瑞 物理
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*註:96年度起更改名稱「行政院傑出科技貢獻獎」

年   度 獲獎人 系所別
72年度 楊振忠 生科
78年度 王弈凱 化工
82年度 馬振基 化工
83~90年度 無人獲獎
92年度 陳壽安 化工
93年度 朱國瑞 物理
96年度 江安世 生科
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年   度 獲獎人 系所別
80年度 王弈凱 化工
馬振基 化工
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傑出金玉傑出年青學者獎
年 度 任教系所 獲 獎 教 授
96年度 數學系 陳俊成教授
96年度 物理系 王立邦教授
97年度 天文所 江國興教授
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龍騰微笑競賽獎
年 度 任教系所 獲 獎 教 授
96年度(第二屆) 奈微所 葉哲良教授
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國家新創獎
年 度 任教系所 獲 獎 教 授
2007年(第五屆) 化學系 胡紀如教授
2007年(第五屆) 動機系 楊鏡堂教授
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